Los ateneos clínicos surgieron a partir de la iniciativa de Jakairá y las distintas instituciones que trabajan en conjunto, para establecer un espacio de reflexión e intercambio en relación a las problemáticas que atañen a niños y adolescentes en situaciones de riesgo y derechos vulnerados. En los primeros ateneos clínicos, año 2004, Jakairá hizo presentaciones de casos clínicos, en el 2005 se invitó a que las otras instituciones participantes lo hicieran.

2006
•  10 de mayo, expusieron los integrantes del Hogar Convivencial para madres adolescentes "María Eva Duarte". Asistieron representantes de las siguientes instituciones: CAINA, Amartya y Puentes Escolares.

2005
•  14 de diciembre, expusieron los integrantes del Hogar Convivencial para madres adolescentes "María Eva Duarte". Asistieron representantes de las siguientes instituciones: Hogar Eva Duarte, Programa de Retención Escolar y CAINA.

•  6 de octubre expusieron los integrantes de IELADEINU, sus destinatarios son familias de la comunidad judía cuyos niños estén padeciendo algún tipo de maltrato físico o psicológico, abuso sexual o violencia familiar. Cuenta con Fortalecimiento familiar, centro de día y hogar convivencial. Asistieron representantes de las siguientes instituciones: Hogar Eva Duarte, FUNDAV y Proyecto retención escolar de alumnas embarazadas, madres y alumnos padres en escuelas medias y técnicas de la ciudad.

•  7 de julio, expusieron los integrantes de Maderera Córdoba, Bachillerato para jóvenes y adultos. Asistieron representantes de las siguientes instituciones: CAINA, Ieladeinu y EOS.

•  28 de abril, expuso el CAINA, Centro de Atención Integral de la Niñez y Adolescencia, centro de día para chicos en la calle de Buenos Aires. Asistieron representantes de las siguientes instituciones: CAINA, FUNDAV, Hogar Eva Duarte, Ieladeinu, Maderera Córdoba, Puentes Escolares, Amanecer, un estudiante de escuela secundaria Waldorf y un profesional en trabajo social.

2004
•  El 10 de noviembre, asistieron representantes de la siguientes instituciones: CAINA, Defensoría de Caballito, Raíces, Hogar Eva Duarte, Hogar Andamio, CGP Nº 11, CGP Nº13, IELADEINU, Ayudando a los que ayudan.

•  El 11 de agosto, asistieron representantes de las siguientes instituciones: Raíces, Hogar Eva Duarte, FUNDAV, Hogar Andamio, La Matera, CAINA, Defensoría de derechos de Chacarita-Paternal, Programa de Retención Escolar y EOS.

•  El 29 de mayo, asistieron representantes de las siguientes instituciones: Hogar Eva Duarte, CGP13, Hospital Gutiérrez, Servicio social del CGP Nº 11, Programa de Retención Escolar, OMEP y de la Defensoría de derechos de Chacarita-Paternal.